En junio de 2007, YouTube comenzó las pruebas de un sistema de detección automática de los vídeos subidos que infrinjan los derechos de autor . El sistema fue considerado por el CEO de Google , Eric Schmidt, según sea necesario para resolver las demandas, como la de Viacom , la cual se alega que YouTube se benefició de contenidos pirateados. El sistema, que se hizo conocido como Content ID, crea un archivo de ID de audio con derechos de autor y el material de vídeo, y la almacena en una base de datos. Cuando se carga un vídeo, que se compara con la base de datos, y las banderas del video como una violación de los derechos de autor, si se encuentra una coincidencia. Cuando esto ocurre, el propietario del contenido tiene la opción de bloquear el vídeo para que sea unviewable, el seguimiento de las estadísticas de visión de la de vídeo, o la adición de anuncios para el vídeo. YouTube se describe de identificación de contenido como “muy preciso en la búsqueda de archivos que se parecen a los archivos de referencia que son de una longitud suficiente y de calidad para generar un archivo de identificación eficaz”. cuentas de ID de contenido de más de un tercio de los puntos de vista monetarios en YouTube.
Una prueba independiente en el año 2009 cargado de múltiples versiones de la misma canción en YouTube, y concluyó que mientras el sistema estaba “sorprendentemente resistentes” en la búsqueda de violaciónes de derechos de autor en las pistas de audio de los videos, no es infalible. El uso de identificación de contenido para eliminar el material de forma automática se ha llevado a la controversia, en algunos casos, como los videos no han sido verificados por un ser humano para el uso justo . Si un usuario de YouTube está en desacuerdo con una decisión de identificación de contenido, es posible rellenar un formulario de disputa la decisión. YouTube ha citado a la eficacia de la identificación de contenido como una de las razones por las que las reglas del sitio fueron modificados en diciembre de 2010 para permitir a algunos usuarios a subir videos de duración ilimitada.